Theo thông tin từ Cục Quản lý đê điều và phòng, chống thiên tai (Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn), tính đến 6 giờ sáng ngày 12/9, thiệt hại do bão số 3 và mưa lũ sau bão đã gây ra là rất nghiêm trọng. Tổng số người chết và mất tích hiện đã lên tới 326, trong đó có 181 người tử vong và 145 người mất tích.
Cụ thể do bão số 3, thiệt hại phân bổ theo các địa phương như sau:
- Lào Cai: 183 người (72 người chết, 111 người mất tích), bao gồm các khu vực: Bảo Yên 113, Sa Pa 9, Bát Xát 18, Si Ma Cai 7, Bắc Hà 34, Văn Bàn 2.
- Cao Bằng: 52 người (34 người chết, 18 người mất tích).
- Yên Bái: 44 người (40 người chết, 4 người mất tích), gồm: Thành phố Yên Bái 21, Lục Yên 14, Văn Yên 6, Văn Chấn 1, Trấn Yên 2.
- Quảng Ninh: 15 người chết.
- Hải Phòng: 2 người chết do bão.
- Hải Dương: 1 người chết do bão.
- Hà Nội: 1 người chết do bão.
- Hòa Bình: 5 người chết do sạt lở đất.
- Lạng Sơn: 3 người chết do lũ cuốn và sạt lở đất.
- Bắc Giang: 2 người chết do lũ cuốn.
- Tuyên Quang: 3 người (2 người chết, 1 người mất tích do lũ).
- Hà Giang: 2 người (1 người chết, 1 người mất tích).
- Lai Châu: 1 người chết do sạt lở đất.
- Vĩnh Phúc: 2 người (1 người chết, 1 người mất tích do lật thuyền).
- Phú Thọ: 10 người (8 người mất tích tại sự cố sập cầu Phong Châu; 1 người mất tích do lũ; 1 người chết do sạt lở đất).
Mưa lũ đã gây ngập lụt nghiêm trọng ở nhiều khu vực thuộc vùng Bắc Bộ, khiến tình hình trở nên cực kỳ căng thẳng.